No vestibular 2012 da Universidade Federal de Sergipe, 29.333 candidatos confirmaram sua inscrição no site da Universidade para 5.490 vagas em 106 cursos distribuídos nos campi de São Cristóvão, Itabaiana, Laranjeiras e Lagarto.
No Vestibular 2013 o critério de seleção será o desempenho dos candidatos no Enem, porém sem utilizar o SiSU. Neste caso, os vestibulandos se inscrevem no Enem e também na universidade. A lista de aprovados é feita pela própria instituição.
Quando todas as provas do Enem são corrigidas, o Inep envia para as universidades as notas obtidas pelos candidatos que se inscreveram.
Em 2012 os cursos mais procurados na UFS foram o de Medicina (20 por vaga), Direito (18) Enfermagem (12) e Engenharia Civil com nove candidatos para cada vaga.
O sistema de cota utilizado pela UFS reserva 50% das vagas a estudantes de escolas públicas e, deste total, 70% são para candidatos que se autodeclararem pardos, índios ou afrodescendentes.