A Universidade Federal do Maranhão tem um o campus sede na capital São Luís e outros cinco campi em Imperatriz, Bacabal, Chapadinha, Floresta e Codó, todos municípios do interior do Estado.
A UFMA utiliza como critério de seleção as notas do Enem através Sistema de Seleção Unificada (SiSU). Além da ampla concorrência, a UFMA destina 4 vagas em cada curso para os índios e deficientes, 25% das vagas para alunos de Escola Pública e 25% para candidatos que se autodeclararem negros.
São 38 os cursos oferecidos pela Universidade na área de Ciências agrárias, Ciências Biológicas, Ciências exatas e tecnológicas, Ciências humanas e Ciências sociais incluindo entre eles, Hotelaria, Desenho Industrial e Oceanografia, um dos poucos no Brasil.
A Universidade disponibiliza cursos de graduação em Química, Biologia, Física e Matemática, na modalidade à distância. A previsão é de que, a partir do 2º semestre de 2012, a UFMA oferte mais de 1.700 vagas nos 11 municípios maranhenses onde haja polos da Universidade Virtual do Estado do Maranhão – Univima.